python实现批量nii文件转换为png图像
之前介绍过单个nii文件转换成png图像:
https://www.nhooo.com/article/165693.htm
这里介绍将多个nii文件(保存在一个文件夹下)转换成png图像。且图像单个文件夹的名称与nii名字相同。
importnumpyasnp importos#遍历文件夹 importnibabelasnib#nii格式一般都会用到这个包 importimageio#转换成图像 defnii_to_image(niifile): filenames=os.listdir(filepath)#读取nii文件夹 slice_trans=[] forfinfilenames: #开始读取nii文件 img_path=os.path.join(filepath,f) img=nib.load(img_path)#读取nii img_fdata=img.get_fdata() fname=f.replace('.nii','')#去掉nii的后缀名 img_f_path=os.path.join(imgfile,fname) #创建nii对应的图像的文件夹 ifnotos.path.exists(img_f_path): os.mkdir(img_f_path)#新建文件夹 #开始转换为图像 (x,y,z)=img.shape foriinrange(z):#z是图像的序列 silce=img_fdata[i,:,:]#选择哪个方向的切片都可以 imageio.imwrite(os.path.join(img_f_path,'{}.png'.format(i)),silce) #保存图像 if__name__=='__main__': filepath='nii的文件夹' imgfile='image的文件夹' nii_to_image(filepath)
代码是我自己写的,用于处理ADNI的nii格式完全有效。
以上就是本文的全部内容,希望对大家的学习有所帮助,也希望大家多多支持毛票票。