Ubuntu+python将nii图像保存成png格式
这里介绍一个nii文件保存为png格式的方法。
这篇文章是介绍多个nii文件保存为png格式的方法：
https://www.nhooo.com/article/165692.htm
系统：Ubuntu16.04
软件：python3.5
先用pip安装nibabel、numpy、imageio、os。
importnibabelasnib
importnumpyasnp
importimageio
importos
defread_niifile(niifile):#读取niifile文件
img=nib.load(niifile)#下载niifile文件（其实是提取文件）
img_fdata=img.get_fdata()#获取niifile数据
returnimg_fdata
defsave_fig(file):#保存为图片
fdata=read_niifile(file)#调用上面的函数，获得数据
(x,y,z)=fdata.shape#获得数据shape信息：（长，宽，维度-切片数量）
forkinrange(z):
silce=fdata[k,:,:]#三个位置表示三个不同角度的切片
imageio.imwrite(os.path.join(savepicdir,'{}.png'.format(k)),silce)
#将切片信息保存为png格式
dir='./.nii'#nii的路径
savepicdir=''#保存png的路径
os.mkdir(savepicdir)#创建文件夹
save_fig(dir)#运行程序，保存为图像
不要忘记返回img_fdata，否则下一个文件会报错。
以上就是本文的全部内容，希望对大家的学习有所帮助，也希望大家多多支持毛票票。