matplotlib基础绘图命令之imshow的使用
在matplotlib中,imshow方法用于绘制热图,基本用法如下
importmatplotlib.pyplotasplt importnumpyasnp np.random.seed(123456789) data=np.random.rand(25).reshape(5,5) plt.imshow(data)
输出结果如下
imshow方法首先将二维数组的值标准化为0到1之间的值,然后根据指定的渐变色依次赋予每个单元格对应的颜色,就形成了热图。对于热图而言,通常我们还需要画出对应的图例,图例通过colorbar方法来实现,代码如下
plt.imshow(data) plt.colorbar()
输出结果如下
imshow方法常用的几个参数如下
1.cmap
cmap是colormap的简称,用于指定渐变色,默认的值为viridis, 在matplotlib中,内置了一系列的渐变色,用法如下
plt.imshow(data,cmap='Greens')
输出结果如下
完整的内置colormap的列表见如下链接
https://matplotlib.org/tutorials/colors/colormaps.html
2.aspect
aspect用于指定热图的单元格的大小,默认值为equal,此时单元格用于是一个方块,当设置为auto时,会根据画布的大小动态调整单元格的大小,用法如下
plt.imshow(data,aspect='auto')
输出结果如下
3.alpha
alpha参数用于指定透明度,用法如下
plt.imshow(data,alpha=0.8)
输出结果如下
4.origin
orign参数指定绘制热图时的方向,默认值为upper, 此时热图的右上角为(0,0), 当设置为lower时,热图的左下角为(0,0), 用法如下
plt.imshow(data,origin='lower')
输出结果如下
5.vmin和vmax
vmin和vmax参数用于限定数值的范围,只将vmin和vmax之间的值进行映射,用法如下
plt.imshow(data,vmin=-0.8,vmax=0.8) plt.colorbar()
输出结果如下
6.interpolation
interprolation参数控制热图的显示形式,是一个较难理解的参数,同样的数据,不同取值对应的热图形式如下
在日常使用而言,nearest和None是应用的最多的。
7.extent
extent参数指定热图x轴和y轴的极值,取值为一个长度为4的元组或列表,其中,前两个数值对应x轴的最小值和最大值,后两个参数对应y轴的最小值和最大值,用法如下
plt.imshow(data,extent=(-0.5,4.5,4.5,-0.5))
输出结果如下
可以看到,上述代码的输出和默认输出完全一致。其实,extent和origin两个参数是相互关联的,origin参数的值为upper时,extent参数的默认值如下
(-0.5,ncol(data)-0.5,nrow(data)-0.5,0.5)
当origin参数的值为lower时,extent参数的默认值如下
(-0.5,ncol(data)-0.5,-0.5,nrow(data)-0.5)
修改extent参数的值,图中单元格对应的刻度会发生变化,示意如下
plt.imshow(data,extent=(-0.5,5.5,-5.5,0.5))
输出结果如下
大多数的情况下,我们都不需要自己来手动指定extent参数的值。
在绘制热图时,还可以结合xlim和ylim参数,来为热图的周围增加空隙,代码如下
plt.imshow(data) plt.xlim(-1,5) plt.ylim(5,-1) plt.colorbar()
输出结果如下
相比R语言中的热图,matplotlib中的热图没有聚类树的功能,需要自己手动来实现,但是可以很方便的添加图例,而且受益于matplotlib灵活的基础功能,可以实现非常复杂的如图。
python使用plt.imshow在坐标轴上展示图片,坐标设置问题。
坐标默认是从上到下,从左到右,例如
matplotlib.pyplot.imshow(X,cmap=None,norm=None,aspect=None,interpolation=None,alpha=None, vmin=None,vmax=None,origin=None,extent=None,shape=None, filternorm=1,filterrad=4.0,imlim=None,resample=None, url=None,hold=None,data=None,**kwargs
他的参数很多,找了很久,才发现,应该是设置origin参数。
origin:[‘upper'|‘lower'],optional,default:None Placethe[0,0]indexofthearrayintheupperleftorlowerleftcorneroftheaxes. IfNone,defaulttorcimage.origin.
设origin=‘lower',就得到如下图:
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