SARS-CoV-2的3D分析揭示了病毒的战术：如何感染人体细胞并进行复制
该分析确定了"模仿"和"劫持"人类蛋白质的病毒蛋白质，这些策略使病毒能够绕过细胞防御系统并进行复制。
这些结构模型可以从Aquaria-COVID资源中免费获取，这是一个由该团队设计的网站，旨在帮助研究界为未来的治疗或疫苗"放大"病毒的潜在新目标，并且关键是调查新的病毒变种：
https://aquaria.ws/covid
"我们的资源包含了SARS-CoV-2结构的详细程度，这是其他地方所没有的。O'Donoghue教授说，他是《分子系统生物学》杂志上一篇详细介绍该团队研究结果的论文的第一作者，这使我们对该病毒的活动有了前所未有的了解。
SARS-CoV-2包膜模型
为了更好地了解生物过程，研究人员确定了单个蛋白质的三维形状--构成细胞或病毒的组成部分。蛋白质的三维结构提供了关于SARS-CoV-2构成的原子分辨率信息，这对于开发针对病毒不同部分的疫苗或治疗方法至关重要。由于最近对SARS-CoV-2的研究重点，科学家们已经确定了该病毒27种单独蛋白质的大约一千种三维结构，还有近一千种相关的蛋白质，然而直到现在，还没有一种简单的方法将所有的数据汇集在一起并对其进行分析。
SARS-CoV-2 RNA合成复合物模型
研究小组的分析揭示了三种冠状病毒蛋白（NSP3、NSP13和NSP16）"模仿"了人类蛋白，研究人员认为这使得病毒能够更好地躲避人类免疫系统，并可能导致COVID-19结果的变化。
该模型还揭示了五种冠状病毒蛋白（NSP1、NSP3、穗状糖蛋白、包膜蛋白和ORF9b蛋白），研究人员说这些蛋白'劫持'或破坏了人体细胞的进程，从而帮助病毒控制，完成其生命周期，并传播到其他细胞。
"此外，我们发现了八种冠状病毒蛋白，它们相互之间进行自我组装--分析它们是如何组装的，为了解病毒如何复制其基因组提供了新的见解。然而，在考虑到重叠之后，这仍然留下了14个我们认为在感染中发挥关键作用的蛋白质，但没有与其他病毒或人类蛋白质互动的结构证据，"O'Donoghue教授说。
SARS-CoV-2穗状糖蛋白和ACE2蛋白模型
"为了让研究人员更容易获得所有这些见解和数据，我们设计了一种新的可视化方法，称为结构覆盖图。该地图突出了我们对SARS-CoV-2的了解，以及仍有待发掘的内容--它也帮助科学家找到并使用3D模型来调查特定的研究问题。"
该团队的分析揭示了进一步研究的机会。"迄今为止，冠状病毒的大部分研究都集中在尖峰糖蛋白上，这是目前疫苗的主要目标。"O'Donoghue教授说："这种蛋白质将继续是一个重要的目标，但同样重要的是我们将重点扩大到其他潜在的目标，并更好地了解整个病毒的生命周期。"他补充说，Aquaria-COVID资源可能会帮助研究人员更容易地调查冠状病毒的新变种如何不同--关键是，如何更好地用疫苗和治疗方法将它们作为目标。
病毒流通的时间越长，它就有越多的机会发生变异并形成新的变种，如Delta病毒株。我们的资源将帮助研究人员了解该病毒的新毒株如何彼此不同--我们希望这块拼图将有助于处理出现的新变种。